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Swiss Federal Institute for Forest (WSL)

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Datasets

GenTree consortium.pdf

A list of people's names, making together the author "GenTree Consortium"

Authors

  • Michotey, Célia ;
  • Scalabrin, Simone ;
  • Pinosio, Sara ;
  • Aravanopoulos, Filippos A. ;
  • Bagnoli, Francesca ;
  • Brodbeck, Sabine ;
  • Cremer, Eva ;
  • Danusevicius, Darius ;
  • Dauphin, Benjamin ;
  • Donnelly, Kevin ;
  • García Barriga, María Carmen ;
  • González-Martinez, Santiago ;
  • Grivet, Delphine ;
  • Gugerli, Felix ;
  • Heer, Katrin ;
  • Jorge, Veronique ;
  • Milesi, Pascal ;
  • Olsson, Sanna ;
  • Piotti, Andrea ;
  • Pyhajarvi, Tanja ;
  • Rellstab, Christian ;
  • Reutimann, Oliver ;
  • Spanu, Ilaria ;
  • Vendramin, Giovanni ;
  • GenTree Consortium ;
  • Fady, Bruno
0 Citations0 Mentions42% FAIR0.9 Dataset Index
10.57745/mr4f6kJanuary 2025

readme.txt

README for the GenTree genotyping dataset

Authors

  • Michotey, Célia ;
  • Scalabrin, Simone ;
  • Pinosio, Sara ;
  • Aravanopoulos, Filippos A. ;
  • Bagnoli, Francesca ;
  • Brodbeck, Sabine ;
  • Cremer, Eva ;
  • Danusevicius, Darius ;
  • Dauphin, Benjamin ;
  • Donnelly, Kevin ;
  • García Barriga, María Carmen ;
  • González-Martinez, Santiago ;
  • Grivet, Delphine ;
  • Gugerli, Felix ;
  • Heer, Katrin ;
  • Jorge, Veronique ;
  • Milesi, Pascal ;
  • Olsson, Sanna ;
  • Piotti, Andrea ;
  • Pyhajarvi, Tanja ;
  • Rellstab, Christian ;
  • Reutimann, Oliver ;
  • Spanu, Ilaria ;
  • Vendramin, Giovanni ;
  • GenTree Consortium ;
  • Fady, Bruno
0 Citations0 Mentions42% FAIR0.5 Dataset Index
10.57745/cvxlnyJanuary 2024

Pabies_filtSNPs.vcf.gz

Picea abies target sequencing - exome capture

Authors

  • Michotey, Célia ;
  • Scalabrin, Simone ;
  • Pinosio, Sara ;
  • Aravanopoulos, Filippos A. ;
  • Bagnoli, Francesca ;
  • Brodbeck, Sabine ;
  • Cremer, Eva ;
  • Danusevicius, Darius ;
  • Dauphin, Benjamin ;
  • Donnelly, Kevin ;
  • García Barriga, María Carmen ;
  • González-Martinez, Santiago ;
  • Grivet, Delphine ;
  • Gugerli, Felix ;
  • Heer, Katrin ;
  • Jorge, Veronique ;
  • Milesi, Pascal ;
  • Olsson, Sanna ;
  • Piotti, Andrea ;
  • Pyhajarvi, Tanja ;
  • Rellstab, Christian ;
  • Reutimann, Oliver ;
  • Spanu, Ilaria ;
  • Vendramin, Giovanni ;
  • GenTree Consortium ;
  • Fady, Bruno
0 Citations0 Mentions42% FAIR0.5 Dataset Index
10.15454/7coc1a/mqd8s9January 2021

Fsylvatica_filtSNPs.vcf.gz

Fagus sylvatica target sequencing - exome capture

Authors

  • Michotey, Célia ;
  • Scalabrin, Simone ;
  • Pinosio, Sara ;
  • Aravanopoulos, Filippos A. ;
  • Bagnoli, Francesca ;
  • Brodbeck, Sabine ;
  • Cremer, Eva ;
  • Danusevicius, Darius ;
  • Dauphin, Benjamin ;
  • Donnelly, Kevin ;
  • García Barriga, María Carmen ;
  • González-Martinez, Santiago ;
  • Grivet, Delphine ;
  • Gugerli, Felix ;
  • Heer, Katrin ;
  • Jorge, Veronique ;
  • Milesi, Pascal ;
  • Olsson, Sanna ;
  • Piotti, Andrea ;
  • Pyhajarvi, Tanja ;
  • Rellstab, Christian ;
  • Reutimann, Oliver ;
  • Spanu, Ilaria ;
  • Vendramin, Giovanni ;
  • GenTree Consortium ;
  • Fady, Bruno
0 Citations0 Mentions42% FAIR0.9 Dataset Index
10.15454/7coc1a/ss8vuoJanuary 2021

Qpetraea_filtSNPs.vcf.gz

Quercus petraea target sequencing - exome capture

Authors

  • Michotey, Célia ;
  • Scalabrin, Simone ;
  • Pinosio, Sara ;
  • Aravanopoulos, Filippos A. ;
  • Bagnoli, Francesca ;
  • Brodbeck, Sabine ;
  • Cremer, Eva ;
  • Danusevicius, Darius ;
  • Dauphin, Benjamin ;
  • Donnelly, Kevin ;
  • García Barriga, María Carmen ;
  • González-Martinez, Santiago ;
  • Grivet, Delphine ;
  • Gugerli, Felix ;
  • Heer, Katrin ;
  • Jorge, Veronique ;
  • Milesi, Pascal ;
  • Olsson, Sanna ;
  • Piotti, Andrea ;
  • Pyhajarvi, Tanja ;
  • Rellstab, Christian ;
  • Reutimann, Oliver ;
  • Spanu, Ilaria ;
  • Vendramin, Giovanni ;
  • GenTree Consortium ;
  • Fady, Bruno
0 Citations0 Mentions42% FAIR0.5 Dataset Index
10.15454/7coc1a/dqpkxgJanuary 2021

Bpendula_filtSNPs.vcf.gz

Betula pendula target sequencing - exome capture

Authors

  • Michotey, Célia ;
  • Scalabrin, Simone ;
  • Pinosio, Sara ;
  • Aravanopoulos, Filippos A. ;
  • Bagnoli, Francesca ;
  • Brodbeck, Sabine ;
  • Cremer, Eva ;
  • Danusevicius, Darius ;
  • Dauphin, Benjamin ;
  • Donnelly, Kevin ;
  • García Barriga, María Carmen ;
  • González-Martinez, Santiago ;
  • Grivet, Delphine ;
  • Gugerli, Felix ;
  • Heer, Katrin ;
  • Jorge, Veronique ;
  • Milesi, Pascal ;
  • Olsson, Sanna ;
  • Piotti, Andrea ;
  • Pyhajarvi, Tanja ;
  • Rellstab, Christian ;
  • Reutimann, Oliver ;
  • Spanu, Ilaria ;
  • Vendramin, Giovanni ;
  • GenTree Consortium ;
  • Fady, Bruno
0 Citations0 Mentions42% FAIR0.5 Dataset Index
10.15454/7coc1a/xfhn2tJanuary 2021

Pnigra_filtSNPs.vcf.gz

Populus nigra target sequencing - exome capture

Authors

  • Michotey, Célia ;
  • Scalabrin, Simone ;
  • Pinosio, Sara ;
  • Aravanopoulos, Filippos A. ;
  • Bagnoli, Francesca ;
  • Brodbeck, Sabine ;
  • Cremer, Eva ;
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  • Dauphin, Benjamin ;
  • Donnelly, Kevin ;
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  • González-Martinez, Santiago ;
  • Grivet, Delphine ;
  • Gugerli, Felix ;
  • Heer, Katrin ;
  • Jorge, Veronique ;
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  • Spanu, Ilaria ;
  • Vendramin, Giovanni ;
  • GenTree Consortium ;
  • Fady, Bruno
0 Citations0 Mentions42% FAIR1.0 Dataset Index
10.15454/7coc1a/ksyzvqJanuary 2021

Ppinaster_filtSNPs.vcf.gz

Pinus pinaster target sequencing - exome capture

Authors

  • Michotey, Célia ;
  • Scalabrin, Simone ;
  • Pinosio, Sara ;
  • Aravanopoulos, Filippos A. ;
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  • Heer, Katrin ;
  • Jorge, Veronique ;
  • Milesi, Pascal ;
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  • Pyhajarvi, Tanja ;
  • Rellstab, Christian ;
  • Reutimann, Oliver ;
  • Spanu, Ilaria ;
  • Vendramin, Giovanni ;
  • GenTree Consortium ;
  • Fady, Bruno
0 Citations0 Mentions42% FAIR1.0 Dataset Index
10.15454/7coc1a/qgffzcJanuary 2021

Phalepensis_filtSNPs_DENOVO.vcf.gz

Pinus halepensis target sequencing - SPET

Authors

  • Michotey, Célia ;
  • Scalabrin, Simone ;
  • Pinosio, Sara ;
  • Aravanopoulos, Filippos A. ;
  • Bagnoli, Francesca ;
  • Brodbeck, Sabine ;
  • Cremer, Eva ;
  • Danusevicius, Darius ;
  • Dauphin, Benjamin ;
  • Donnelly, Kevin ;
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  • González-Martinez, Santiago ;
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  • Heer, Katrin ;
  • Jorge, Veronique ;
  • Milesi, Pascal ;
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  • Pyhajarvi, Tanja ;
  • Rellstab, Christian ;
  • Reutimann, Oliver ;
  • Spanu, Ilaria ;
  • Vendramin, Giovanni ;
  • GenTree Consortium ;
  • Fady, Bruno
0 Citations0 Mentions42% FAIR0.5 Dataset Index
10.15454/7coc1a/kvtqcbJanuary 2021

Aalba_filtSNPs_DENOVO.vcf.gz

Abies alba target sequencing - SPET

Authors

  • Michotey, Célia ;
  • Scalabrin, Simone ;
  • Pinosio, Sara ;
  • Aravanopoulos, Filippos A. ;
  • Bagnoli, Francesca ;
  • Brodbeck, Sabine ;
  • Cremer, Eva ;
  • Danusevicius, Darius ;
  • Dauphin, Benjamin ;
  • Donnelly, Kevin ;
  • García Barriga, María Carmen ;
  • González-Martinez, Santiago ;
  • Grivet, Delphine ;
  • Gugerli, Felix ;
  • Heer, Katrin ;
  • Jorge, Veronique ;
  • Milesi, Pascal ;
  • Olsson, Sanna ;
  • Piotti, Andrea ;
  • Pyhajarvi, Tanja ;
  • Rellstab, Christian ;
  • Reutimann, Oliver ;
  • Spanu, Ilaria ;
  • Vendramin, Giovanni ;
  • GenTree Consortium ;
  • Fady, Bruno
0 Citations0 Mentions42% FAIR0.9 Dataset Index
10.15454/7coc1a/z1m1cpJanuary 2021