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Mingbo Cheng

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Processed Data 1 : Spatial multi-omic map of human myocardial infarction

We provide here the processed snRNA-seq, snATAC-seq, and visium data for the manuscript: Kuppe, Ramirez Flores, Li et al. "Spatial multi-omic map of human myocardial infarction", 2022

Authors

  • Kuppe, Christoph ;
  • Flores, Ricardo O. Ramirez ;
  • Zhijian Li ;
  • Sikander Hayat ;
  • Levinson, Rebecca T. ;
  • Liao, Xian ;
  • Hannani, Monica T. ;
  • Tanevski, Jovan ;
  • Wünnemann, Florian ;
  • Nagai, James S. ;
  • Halder, Maurice ;
  • Schumacher, David ;
  • Menzel, Sylvia ;
  • Schäfer, Gideon ;
  • Hoeft, Konrad ;
  • Mingbo Cheng ;
  • Ziegler, Susanne ;
  • Xiaoting Zhang ;
  • Peisker, Fabian ;
  • Kaesler, Nadine ;
  • Saritas, Turgay ;
  • Yaoxian Xu ;
  • Kassner, Astrid ;
  • Gummert, Jan ;
  • Morshuis, Michiel ;
  • Junedh Amrute ;
  • Veltrop, Rogier J. A. ;
  • Boor, Peter ;
  • Klingel, Karin ;
  • Van Laake, Linda W. ;
  • Vink, Aryan ;
  • Hoogenboezem, Remco M. ;
  • Bindels, Eric M.J. ;
  • Schurgers, Leon ;
  • Sattler, Susanne ;
  • Schapiro, Denis ;
  • Schneider, Rebekka K. ;
  • Lavine, Kory ;
  • Milting, Hendrik ;
  • Costa, Ivan G. ;
  • Saez-Rodriguez, Julio ;
  • Kramann, Rafael
3 Citations0 Mentions79% FAIR1.7 Dataset Index
10.5281/zenodo.65780472022

Processed Data 1 : Spatial multi-omic map of human myocardial infarction

We provide here the processed snRNA-seq, snATAC-seq, and visium data for the manuscript: Kuppe, Ramirez Flores, Li et al. "Spatial multi-omic map of human myocardial infarction", 2022

Authors

  • Kuppe, Christoph ;
  • Flores, Ricardo O. Ramirez ;
  • Zhijian Li ;
  • Sikander Hayat ;
  • Levinson, Rebecca T. ;
  • Liao, Xian ;
  • Hannani, Monica T. ;
  • Tanevski, Jovan ;
  • Wünnemann, Florian ;
  • Nagai, James S. ;
  • Halder, Maurice ;
  • Schumacher, David ;
  • Menzel, Sylvia ;
  • Schäfer, Gideon ;
  • Hoeft, Konrad ;
  • Mingbo Cheng ;
  • Ziegler, Susanne ;
  • Xiaoting Zhang ;
  • Peisker, Fabian ;
  • Kaesler, Nadine ;
  • Saritas, Turgay ;
  • Yaoxian Xu ;
  • Kassner, Astrid ;
  • Gummert, Jan ;
  • Morshuis, Michiel ;
  • Junedh Amrute ;
  • Veltrop, Rogier J. A. ;
  • Boor, Peter ;
  • Klingel, Karin ;
  • Van Laake, Linda W. ;
  • Vink, Aryan ;
  • Hoogenboezem, Remco M. ;
  • Bindels, Eric M.J. ;
  • Schurgers, Leon ;
  • Sattler, Susanne ;
  • Schapiro, Denis ;
  • Schneider, Rebekka K. ;
  • Lavine, Kory ;
  • Milting, Hendrik ;
  • Costa, Ivan G. ;
  • Saez-Rodriguez, Julio ;
  • Kramann, Rafael
3 Citations0 Mentions69% FAIR1.8 Dataset Index
10.5281/zenodo.65780462022

Raw Data - Part 2 : Spatial multi-omic map of human myocardial infarction

We provide here the raw data of snATAC-seq and snRNA-seq for the manuscript: Kuppe, Ramirez Flores, Li et al. "Spatial multi-omic map of human myocardial infarction", 2022

Authors

  • Kuppe, Christoph ;
  • Flores, Ricardo O. Ramirez ;
  • Zhijian Li ;
  • Sikander Hayat ;
  • Levinson, Rebecca T. ;
  • Liao, Xian ;
  • Hannani, Monica T. ;
  • Tanevski, Jovan ;
  • Wünnemann, Florian ;
  • Nagai, James S. ;
  • Halder, Maurice ;
  • Schumacher, David ;
  • Menzel, Sylvia ;
  • Schäfer, Gideon ;
  • Hoeft, Konrad ;
  • Mingbo Cheng ;
  • Ziegler, Susanne ;
  • Xiaoting Zhang ;
  • Peisker, Fabian ;
  • Kaesler, Nadine ;
  • Saritas, Turgay ;
  • Yaoxian Xu ;
  • Kassner, Astrid ;
  • Gummert, Jan ;
  • Morshuis, Michiel ;
  • Junedh Amrute ;
  • Veltrop, Rogier J. A. ;
  • Boor, Peter ;
  • Klingel, Karin ;
  • Van Laake, Linda W. ;
  • Vink, Aryan ;
  • Hoogenboezem, Remco M. ;
  • Bindels, Eric M.J. ;
  • Schurgers, Leon ;
  • Sattler, Susanne ;
  • Schapiro, Denis ;
  • Schneider, Rebekka K. ;
  • Lavine, Kory ;
  • Milting, Hendrik ;
  • Costa, Ivan G. ;
  • Saez-Rodriguez, Julio ;
  • Kramann, Rafael
0 Citations0 Mentions69% FAIR0.4 Dataset Index
10.5281/zenodo.65786162022

Raw Data - Part 1 : Spatial multi-omic map of human myocardial infarction

We provide here the raw data of snATAC-seq for the manuscript: Kuppe, Ramirez Flores, Li et al. "Spatial multi-omic map of human myocardial infarction", 2022

Authors

  • Kuppe, Christoph ;
  • Flores, Ricardo O. Ramirez ;
  • Zhijian Li ;
  • Sikander Hayat ;
  • Levinson, Rebecca T. ;
  • Liao, Xian ;
  • Hannani, Monica T. ;
  • Tanevski, Jovan ;
  • Wünnemann, Florian ;
  • Nagai, James S. ;
  • Halder, Maurice ;
  • Schumacher, David ;
  • Menzel, Sylvia ;
  • Schäfer, Gideon ;
  • Hoeft, Konrad ;
  • Mingbo Cheng ;
  • Ziegler, Susanne ;
  • Xiaoting Zhang ;
  • Peisker, Fabian ;
  • Kaesler, Nadine ;
  • Saritas, Turgay ;
  • Yaoxian Xu ;
  • Kassner, Astrid ;
  • Gummert, Jan ;
  • Morshuis, Michiel ;
  • Junedh Amrute ;
  • Veltrop, Rogier J. A. ;
  • Boor, Peter ;
  • Klingel, Karin ;
  • Van Laake, Linda W. ;
  • Vink, Aryan ;
  • Hoogenboezem, Remco M. ;
  • Bindels, Eric M.J. ;
  • Schurgers, Leon ;
  • Sattler, Susanne ;
  • Schapiro, Denis ;
  • Schneider, Rebekka K. ;
  • Lavine, Kory ;
  • Milting, Hendrik ;
  • Costa, Ivan G. ;
  • Saez-Rodriguez, Julio ;
  • Kramann, Rafael
0 Citations0 Mentions79% FAIR0.5 Dataset Index
10.5281/zenodo.65785522022

Raw Data - Part 2 : Spatial multi-omic map of human myocardial infarction

We provide here the raw data of snATAC-seq and snRNA-seq for the manuscript: Kuppe, Ramirez Flores, Li et al. "Spatial multi-omic map of human myocardial infarction", 2022

Authors

  • Kuppe, Christoph ;
  • Flores, Ricardo O. Ramirez ;
  • Zhijian Li ;
  • Sikander Hayat ;
  • Levinson, Rebecca T. ;
  • Liao, Xian ;
  • Hannani, Monica T. ;
  • Tanevski, Jovan ;
  • Wünnemann, Florian ;
  • Nagai, James S. ;
  • Halder, Maurice ;
  • Schumacher, David ;
  • Menzel, Sylvia ;
  • Schäfer, Gideon ;
  • Hoeft, Konrad ;
  • Mingbo Cheng ;
  • Ziegler, Susanne ;
  • Xiaoting Zhang ;
  • Peisker, Fabian ;
  • Kaesler, Nadine ;
  • Saritas, Turgay ;
  • Yaoxian Xu ;
  • Kassner, Astrid ;
  • Gummert, Jan ;
  • Morshuis, Michiel ;
  • Junedh Amrute ;
  • Veltrop, Rogier J. A. ;
  • Boor, Peter ;
  • Klingel, Karin ;
  • Van Laake, Linda W. ;
  • Vink, Aryan ;
  • Hoogenboezem, Remco M. ;
  • Bindels, Eric M.J. ;
  • Schurgers, Leon ;
  • Sattler, Susanne ;
  • Schapiro, Denis ;
  • Schneider, Rebekka K. ;
  • Lavine, Kory ;
  • Milting, Hendrik ;
  • Costa, Ivan G. ;
  • Saez-Rodriguez, Julio ;
  • Kramann, Rafael
0 Citations0 Mentions69% FAIR0.4 Dataset Index
10.5281/zenodo.65786172022

Raw Data - Part 1 : Spatial multi-omic map of human myocardial infarction

We provide here the raw data of snATAC-seq for the manuscript: Kuppe, Ramirez Flores, Li et al. "Spatial multi-omic map of human myocardial infarction", 2022

Authors

  • Kuppe, Christoph ;
  • Flores, Ricardo O. Ramirez ;
  • Zhijian Li ;
  • Sikander Hayat ;
  • Levinson, Rebecca T. ;
  • Liao, Xian ;
  • Hannani, Monica T. ;
  • Tanevski, Jovan ;
  • Wünnemann, Florian ;
  • Nagai, James S. ;
  • Halder, Maurice ;
  • Schumacher, David ;
  • Menzel, Sylvia ;
  • Schäfer, Gideon ;
  • Hoeft, Konrad ;
  • Mingbo Cheng ;
  • Ziegler, Susanne ;
  • Xiaoting Zhang ;
  • Peisker, Fabian ;
  • Kaesler, Nadine ;
  • Saritas, Turgay ;
  • Yaoxian Xu ;
  • Kassner, Astrid ;
  • Gummert, Jan ;
  • Morshuis, Michiel ;
  • Junedh Amrute ;
  • Veltrop, Rogier J. A. ;
  • Boor, Peter ;
  • Klingel, Karin ;
  • Van Laake, Linda W. ;
  • Vink, Aryan ;
  • Hoogenboezem, Remco M. ;
  • Bindels, Eric M.J. ;
  • Schurgers, Leon ;
  • Sattler, Susanne ;
  • Schapiro, Denis ;
  • Schneider, Rebekka K. ;
  • Lavine, Kory ;
  • Milting, Hendrik ;
  • Costa, Ivan G. ;
  • Saez-Rodriguez, Julio ;
  • Kramann, Rafael
0 Citations0 Mentions69% FAIR0.4 Dataset Index
10.5281/zenodo.65785532022

Single Nucleus ATAC Sequencing Reveals Epigenomic Regulation After Myocardial Infarction

SeuratObject, we used snATAC product from 10x Genomics to profile myocardial infarction (MI) at Day 0, 3 and 10.

Authors

  • Schumacher, David ;
  • Mingbo Cheng ;
  • Kuppe, Christoph ;
  • Bindels, Eric MJ ;
  • Schneider, Rebekka K. ;
  • Zhijian Li ;
  • Costa, Ivan G ;
  • Kramann, Rafael
0 Citations0 Mentions79% FAIR0.5 Dataset Index
10.5281/zenodo.45416902022

Single Nucleus ATAC Sequencing Reveals Epigenomic Regulation After Myocardial Infarction

SeuratObject, we used snATAC product from 10x Genomics to profile myocardial infarction (MI) at Day 0, 3 and 10.

Authors

  • Schumacher, David ;
  • Mingbo Cheng ;
  • Kuppe, Christoph ;
  • Bindels, Eric MJ ;
  • Schneider, Rebekka K. ;
  • Zhijian Li ;
  • Costa, Ivan G ;
  • Kramann, Rafael
0 Citations0 Mentions50% FAIR0.3 Dataset Index
10.5281/zenodo.45416912022