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Jakubowska, Anna

Pomeranian Medical University

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Datasets

Additional file 3 of PredictCBC-2.0: a contralateral breast cancer risk prediction model developed and validated in ~ 200,000 patients

Additional file 1: Table S3. Patient and primary breast cancer characteristics per study.

Authors

  • Giardiello, Daniele ;
  • Hooning, Maartje J. ;
  • Hauptmann, Michael ;
  • Keeman, Renske ;
  • Heemskerk-Gerritsen, B. A. M. ;
  • Becher, Heiko ;
  • Blomqvist, Carl ;
  • Bojesen, Stig E. ;
  • Bolla, Manjeet K. ;
  • Camp, Nicola J. ;
  • Czene, Kamila ;
  • Devilee, Peter ;
  • Eccles, Diana M. ;
  • Fasching, Peter A. ;
  • Figueroa, Jonine D. ;
  • Flyger, Henrik ;
  • García-Closas, Montserrat ;
  • Haiman, Christopher A. ;
  • Hamann, Ute ;
  • Hopper, John L. ;
  • Jakubowska, Anna ;
  • Leeuwen, Floor E. ;
  • Lindblom, Annika ;
  • Lubiński, Jan ;
  • Margolin, Sara ;
  • Martinez, Maria Elena ;
  • Nevanlinna, Heli ;
  • Nevelsteen, Ines ;
  • Pelders, Saskia ;
  • Pharoah, Paul D. P. ;
  • Siesling, Sabine ;
  • Southey, Melissa C. ;
  • van der Hout, Annemieke H. ;
  • van Hest, Liselotte P. ;
  • Chang-Claude, Jenny ;
  • Hall, Per ;
  • Easton, Douglas F. ;
  • Steyerberg, Ewout W. ;
  • Schmidt, Marjanka K.
0 Citations0 Mentions85% FAIR0.5 Dataset Index
10.6084/m9.figshare.21382883.v12022

Additional file 2 of Breast cancer risks associated with missense variants in breast cancer susceptibility genes

Additional file 2.

Authors

  • Dorling, Leila ;
  • Carvalho, Sara ;
  • Allen, Jamie ;
  • Parsons, Michael T. ;
  • Fortuno, Cristina ;
  • González-Neira, Anna ;
  • Heijl, Stephan M. ;
  • Adank, Muriel A. ;
  • Ahearn, Thomas U. ;
  • Andrulis, Irene L. ;
  • Auvinen, Päivi ;
  • Becher, Heiko ;
  • Beckmann, Matthias W. ;
  • Behrens, Sabine ;
  • Bermisheva, Marina ;
  • Bogdanova, Natalia V. ;
  • Bojesen, Stig E. ;
  • Bolla, Manjeet K. ;
  • Bremer, Michael ;
  • Briceno, Ignacio ;
  • Camp, Nicola J. ;
  • Campbell, Archie ;
  • Castelao, Jose E. ;
  • Chang-Claude, Jenny ;
  • Chanock, Stephen J. ;
  • Chenevix-Trench, Georgia ;
  • Collée, J. Margriet ;
  • Czene, Kamila ;
  • Dennis, Joe ;
  • Dörk, Thilo ;
  • Eriksson, Mikael ;
  • Evans, D. Gareth ;
  • Fasching, Peter A. ;
  • Figueroa, Jonine ;
  • Flyger, Henrik ;
  • Gabrielson, Marike ;
  • Gago-Dominguez, Manuela ;
  • García-Closas, Montserrat ;
  • Giles, Graham G. ;
  • Glendon, Gord ;
  • Guénel, Pascal ;
  • Gündert, Melanie ;
  • Hadjisavvas, Andreas ;
  • Hahnen, Eric ;
  • Hall, Per ;
  • Hamann, Ute ;
  • Harkness, Elaine F. ;
  • Hartman, Mikael ;
  • Hogervorst, Frans B. L. ;
  • Hollestelle, Antoinette ;
  • Hoppe, Reiner ;
  • Howell, Anthony ;
  • Jakubowska, Anna ;
  • Jung, Audrey ;
  • Khusnutdinova, Elza ;
  • Kim, Sung-Won ;
  • Ko, Yon-Dschun ;
  • Kristensen, Vessela N. ;
  • Lakeman, Inge M. M. ;
  • Li, Jingmei ;
  • Lindblom, Annika ;
  • Loizidou, Maria A. ;
  • Lophatananon, Artitaya ;
  • Lubiński, Jan ;
  • Luccarini, Craig ;
  • Madsen, Michael J. ;
  • Mannermaa, Arto ;
  • Manoochehri, Mehdi ;
  • Margolin, Sara ;
  • Mavroudis, Dimitrios ;
  • Milne, Roger L. ;
  • Mohd Taib, Nur Aishah ;
  • Muir, Kenneth ;
  • Nevanlinna, Heli ;
  • Newman, William G. ;
  • Oosterwijk, Jan C. ;
  • Park, Sue K. ;
  • Peterlongo, Paolo ;
  • Radice, Paolo ;
  • Saloustros, Emmanouil ;
  • Sawyer, Elinor J. ;
  • Schmutzler, Rita K. ;
  • Shah, Mitul ;
  • Sim, Xueling ;
  • Southey, Melissa C. ;
  • Surowy, Harald ;
  • Suvanto, Maija ;
  • Tomlinson, Ian ;
  • Torres, Diana ;
  • Truong, Thérèse ;
  • van Asperen, Christi J. ;
  • Waltes, Regina ;
  • Wang, Qin ;
  • Yang, Xiaohong R. ;
  • Pharoah, Paul D. P. ;
  • Schmidt, Marjanka K. ;
  • Benitez, Javier ;
  • Vroling, Bas ;
  • Dunning, Alison M. ;
  • Teo, Soo Hwang ;
  • Kvist, Anders ;
  • de la Hoya, Miguel ;
  • Devilee, Peter ;
  • Spurdle, Amanda B. ;
  • Vreeswijk, Maaike P. G. ;
  • Easton, Douglas F.
1 Citation0 Mentions85% FAIR1.0 Dataset Index
10.6084/m9.figshare.19793180.v12022

Additional file 2 of PredictCBC-2.0: a contralateral breast cancer risk prediction model developed and validated in ~ 200,000 patients

Additional file 2: Table S1. Description of the studies included in the analyses.

Authors

  • Giardiello, Daniele ;
  • Hooning, Maartje J. ;
  • Hauptmann, Michael ;
  • Keeman, Renske ;
  • Heemskerk-Gerritsen, B. A. M. ;
  • Becher, Heiko ;
  • Blomqvist, Carl ;
  • Bojesen, Stig E. ;
  • Bolla, Manjeet K. ;
  • Camp, Nicola J. ;
  • Czene, Kamila ;
  • Devilee, Peter ;
  • Eccles, Diana M. ;
  • Fasching, Peter A. ;
  • Figueroa, Jonine D. ;
  • Flyger, Henrik ;
  • García-Closas, Montserrat ;
  • Haiman, Christopher A. ;
  • Hamann, Ute ;
  • Hopper, John L. ;
  • Jakubowska, Anna ;
  • Leeuwen, Floor E. ;
  • Lindblom, Annika ;
  • Lubiński, Jan ;
  • Margolin, Sara ;
  • Martinez, Maria Elena ;
  • Nevanlinna, Heli ;
  • Nevelsteen, Ines ;
  • Pelders, Saskia ;
  • Pharoah, Paul D. P. ;
  • Siesling, Sabine ;
  • Southey, Melissa C. ;
  • van der Hout, Annemieke H. ;
  • van Hest, Liselotte P. ;
  • Chang-Claude, Jenny ;
  • Hall, Per ;
  • Easton, Douglas F. ;
  • Steyerberg, Ewout W. ;
  • Schmidt, Marjanka K.
0 Citations0 Mentions85% FAIR0.5 Dataset Index
10.6084/m9.figshare.213828802022

Additional file 2 of PredictCBC-2.0: a contralateral breast cancer risk prediction model developed and validated in ~ 200,000 patients

Additional file 2: Table S1. Description of the studies included in the analyses.

Authors

  • Giardiello, Daniele ;
  • Hooning, Maartje J. ;
  • Hauptmann, Michael ;
  • Keeman, Renske ;
  • Heemskerk-Gerritsen, B. A. M. ;
  • Becher, Heiko ;
  • Blomqvist, Carl ;
  • Bojesen, Stig E. ;
  • Bolla, Manjeet K. ;
  • Camp, Nicola J. ;
  • Czene, Kamila ;
  • Devilee, Peter ;
  • Eccles, Diana M. ;
  • Fasching, Peter A. ;
  • Figueroa, Jonine D. ;
  • Flyger, Henrik ;
  • García-Closas, Montserrat ;
  • Haiman, Christopher A. ;
  • Hamann, Ute ;
  • Hopper, John L. ;
  • Jakubowska, Anna ;
  • Leeuwen, Floor E. ;
  • Lindblom, Annika ;
  • Lubiński, Jan ;
  • Margolin, Sara ;
  • Martinez, Maria Elena ;
  • Nevanlinna, Heli ;
  • Nevelsteen, Ines ;
  • Pelders, Saskia ;
  • Pharoah, Paul D. P. ;
  • Siesling, Sabine ;
  • Southey, Melissa C. ;
  • van der Hout, Annemieke H. ;
  • van Hest, Liselotte P. ;
  • Chang-Claude, Jenny ;
  • Hall, Per ;
  • Easton, Douglas F. ;
  • Steyerberg, Ewout W. ;
  • Schmidt, Marjanka K.
0 Citations0 Mentions85% FAIR0.5 Dataset Index
10.6084/m9.figshare.21382880.v12022

Additional file 3 of PredictCBC-2.0: a contralateral breast cancer risk prediction model developed and validated in ~ 200,000 patients

Additional file 1: Table S3. Patient and primary breast cancer characteristics per study.

Authors

  • Giardiello, Daniele ;
  • Hooning, Maartje J. ;
  • Hauptmann, Michael ;
  • Keeman, Renske ;
  • Heemskerk-Gerritsen, B. A. M. ;
  • Becher, Heiko ;
  • Blomqvist, Carl ;
  • Bojesen, Stig E. ;
  • Bolla, Manjeet K. ;
  • Camp, Nicola J. ;
  • Czene, Kamila ;
  • Devilee, Peter ;
  • Eccles, Diana M. ;
  • Fasching, Peter A. ;
  • Figueroa, Jonine D. ;
  • Flyger, Henrik ;
  • García-Closas, Montserrat ;
  • Haiman, Christopher A. ;
  • Hamann, Ute ;
  • Hopper, John L. ;
  • Jakubowska, Anna ;
  • Leeuwen, Floor E. ;
  • Lindblom, Annika ;
  • Lubiński, Jan ;
  • Margolin, Sara ;
  • Martinez, Maria Elena ;
  • Nevanlinna, Heli ;
  • Nevelsteen, Ines ;
  • Pelders, Saskia ;
  • Pharoah, Paul D. P. ;
  • Siesling, Sabine ;
  • Southey, Melissa C. ;
  • van der Hout, Annemieke H. ;
  • van Hest, Liselotte P. ;
  • Chang-Claude, Jenny ;
  • Hall, Per ;
  • Easton, Douglas F. ;
  • Steyerberg, Ewout W. ;
  • Schmidt, Marjanka K.
0 Citations0 Mentions85% FAIR0.5 Dataset Index
10.6084/m9.figshare.213828832022

Additional file 1 of Common variants in breast cancer risk loci predispose to distinct tumor subtypes

Additional file 1. Figures S1 and S2 and Table S1-S4. This file contains supplementary figures 1-2 and supplementary tables 1-4.

Authors

  • Ahearn, Thomas U. ;
  • Zhang, Haoyu ;
  • Michailidou, Kyriaki ;
  • Milne, Roger L. ;
  • Bolla, Manjeet K. ;
  • Dennis, Joe ;
  • Dunning, Alison M. ;
  • Lush, Michael ;
  • Wang, Qin ;
  • Andrulis, Irene L. ;
  • Anton-Culver, Hoda ;
  • Arndt, Volker ;
  • Aronson, Kristan J. ;
  • Auer, Paul L. ;
  • Augustinsson, Annelie ;
  • Baten, Adinda ;
  • Becher, Heiko ;
  • Behrens, Sabine ;
  • Benitez, Javier ;
  • Bermisheva, Marina ;
  • Blomqvist, Carl ;
  • Bojesen, Stig E. ;
  • Bonanni, Bernardo ;
  • Børresen-Dale, Anne-Lise ;
  • Brauch, Hiltrud ;
  • Brenner, Hermann ;
  • Brooks-Wilson, Angela ;
  • Brüning, Thomas ;
  • Burwinkel, Barbara ;
  • Buys, Saundra S. ;
  • Canzian, Federico ;
  • Castelao, Jose E. ;
  • Chang-Claude, Jenny ;
  • Chanock, Stephen J. ;
  • Chenevix-Trench, Georgia ;
  • Clarke, Christine L. ;
  • Collée, J. Margriet ;
  • Cox, Angela ;
  • Cross, Simon S. ;
  • Czene, Kamila ;
  • Daly, Mary B. ;
  • Devilee, Peter ;
  • Dörk, Thilo ;
  • Dwek, Miriam ;
  • Eccles, Diana M. ;
  • Evans, D. Gareth ;
  • Fasching, Peter A. ;
  • Figueroa, Jonine ;
  • Floris, Giuseppe ;
  • Gago-Dominguez, Manuela ;
  • Gapstur, Susan M. ;
  • García-Sáenz, José A. ;
  • Gaudet, Mia M. ;
  • Giles, Graham G. ;
  • Goldberg, Mark S. ;
  • González-Neira, Anna ;
  • Alnæs, Grethe I. Grenaker ;
  • Grip, Mervi ;
  • Guénel, Pascal ;
  • Haiman, Christopher A. ;
  • Hall, Per ;
  • Hamann, Ute ;
  • Harkness, Elaine F. ;
  • Heemskerk-Gerritsen, Bernadette A. M. ;
  • Holleczek, Bernd ;
  • Hollestelle, Antoinette ;
  • Hooning, Maartje J. ;
  • Hoover, Robert N. ;
  • Hopper, John L. ;
  • Howell, Anthony ;
  • Jakimovska, Milena ;
  • Jakubowska, Anna ;
  • John, Esther M. ;
  • Jones, Michael E. ;
  • Jung, Audrey ;
  • Kaaks, Rudolf ;
  • Kauppila, Saila ;
  • Keeman, Renske ;
  • Khusnutdinova, Elza ;
  • Kitahara, Cari M. ;
  • Ko, Yon-Dschun ;
  • Koutros, Stella ;
  • Kristensen, Vessela N. ;
  • Krüger, Ute ;
  • Kubelka-Sabit, Katerina ;
  • Kurian, Allison W. ;
  • Kyriacou, Kyriacos ;
  • Lambrechts, Diether ;
  • Lee, Derrick G. ;
  • Lindblom, Annika ;
  • Linet, Martha ;
  • Lissowska, Jolanta ;
  • Llaneza, Ana ;
  • Lo, Wing-Yee ;
  • MacInnis, Robert J. ;
  • Mannermaa, Arto ;
  • Manoochehri, Mehdi ;
  • Margolin, Sara ;
  • Martinez, Maria Elena ;
  • McLean, Catriona ;
  • Meindl, Alfons ;
  • Menon, Usha ;
  • Nevanlinna, Heli ;
  • Newman, William G. ;
  • Nodora, Jesse ;
  • Offit, Kenneth ;
  • Olsson, Håkan ;
  • Orr, Nick ;
  • Park-Simon, Tjoung-Won ;
  • Patel, Alpa V. ;
  • Peto, Julian ;
  • Pita, Guillermo ;
  • Plaseska-Karanfilska, Dijana ;
  • Prentice, Ross ;
  • Punie, Kevin ;
  • Pylkäs, Katri ;
  • Radice, Paolo ;
  • Rennert, Gad ;
  • Romero, Atocha ;
  • Rüdiger, Thomas ;
  • Saloustros, Emmanouil ;
  • Sampson, Sarah ;
  • Sandler, Dale P. ;
  • Sawyer, Elinor J. ;
  • Schmutzler, Rita K. ;
  • Schoemaker, Minouk J. ;
  • Schöttker, Ben ;
  • Sherman, Mark E. ;
  • Shu, Xiao-Ou ;
  • Smichkoska, Snezhana ;
  • Southey, Melissa C. ;
  • Spinelli, John J. ;
  • Swerdlow, Anthony J. ;
  • Tamimi, Rulla M. ;
  • Tapper, William J. ;
  • Taylor, Jack A. ;
  • Teras, Lauren R. ;
  • Terry, Mary Beth ;
  • Torres, Diana ;
  • Troester, Melissa A. ;
  • Vachon, Celine M. ;
  • van Deurzen, Carolien H. M. ;
  • van Veen, Elke M. ;
  • Wagner, Philippe ;
  • Weinberg, Clarice R. ;
  • Wendt, Camilla ;
  • Wesseling, Jelle ;
  • Winqvist, Robert ;
  • Wolk, Alicja ;
  • Yang, Xiaohong R. ;
  • Zheng, Wei ;
  • Couch, Fergus J. ;
  • Simard, Jacques ;
  • Kraft, Peter ;
  • Easton, Douglas F. ;
  • Pharoah, Paul D. P. ;
  • Schmidt, Marjanka K. ;
  • García-Closas, Montserrat ;
  • Chatterjee, Nilanjan
1 Citation0 Mentions85% FAIR0.8 Dataset Index
10.6084/m9.figshare.178703412022

Additional file 1 of Common variants in breast cancer risk loci predispose to distinct tumor subtypes

Additional file 1. Figures S1 and S2 and Table S1-S4. This file contains supplementary figures 1-2 and supplementary tables 1-4.

Authors

  • Ahearn, Thomas U. ;
  • Zhang, Haoyu ;
  • Michailidou, Kyriaki ;
  • Milne, Roger L. ;
  • Bolla, Manjeet K. ;
  • Dennis, Joe ;
  • Dunning, Alison M. ;
  • Lush, Michael ;
  • Wang, Qin ;
  • Andrulis, Irene L. ;
  • Anton-Culver, Hoda ;
  • Arndt, Volker ;
  • Aronson, Kristan J. ;
  • Auer, Paul L. ;
  • Augustinsson, Annelie ;
  • Baten, Adinda ;
  • Becher, Heiko ;
  • Behrens, Sabine ;
  • Benitez, Javier ;
  • Bermisheva, Marina ;
  • Blomqvist, Carl ;
  • Bojesen, Stig E. ;
  • Bonanni, Bernardo ;
  • Børresen-Dale, Anne-Lise ;
  • Brauch, Hiltrud ;
  • Brenner, Hermann ;
  • Brooks-Wilson, Angela ;
  • Brüning, Thomas ;
  • Burwinkel, Barbara ;
  • Buys, Saundra S. ;
  • Canzian, Federico ;
  • Castelao, Jose E. ;
  • Chang-Claude, Jenny ;
  • Chanock, Stephen J. ;
  • Chenevix-Trench, Georgia ;
  • Clarke, Christine L. ;
  • Collée, J. Margriet ;
  • Cox, Angela ;
  • Cross, Simon S. ;
  • Czene, Kamila ;
  • Daly, Mary B. ;
  • Devilee, Peter ;
  • Dörk, Thilo ;
  • Dwek, Miriam ;
  • Eccles, Diana M. ;
  • Evans, D. Gareth ;
  • Fasching, Peter A. ;
  • Figueroa, Jonine ;
  • Floris, Giuseppe ;
  • Gago-Dominguez, Manuela ;
  • Gapstur, Susan M. ;
  • García-Sáenz, José A. ;
  • Gaudet, Mia M. ;
  • Giles, Graham G. ;
  • Goldberg, Mark S. ;
  • González-Neira, Anna ;
  • Alnæs, Grethe I. Grenaker ;
  • Grip, Mervi ;
  • Guénel, Pascal ;
  • Haiman, Christopher A. ;
  • Hall, Per ;
  • Hamann, Ute ;
  • Harkness, Elaine F. ;
  • Heemskerk-Gerritsen, Bernadette A. M. ;
  • Holleczek, Bernd ;
  • Hollestelle, Antoinette ;
  • Hooning, Maartje J. ;
  • Hoover, Robert N. ;
  • Hopper, John L. ;
  • Howell, Anthony ;
  • Jakimovska, Milena ;
  • Jakubowska, Anna ;
  • John, Esther M. ;
  • Jones, Michael E. ;
  • Jung, Audrey ;
  • Kaaks, Rudolf ;
  • Kauppila, Saila ;
  • Keeman, Renske ;
  • Khusnutdinova, Elza ;
  • Kitahara, Cari M. ;
  • Ko, Yon-Dschun ;
  • Koutros, Stella ;
  • Kristensen, Vessela N. ;
  • Krüger, Ute ;
  • Kubelka-Sabit, Katerina ;
  • Kurian, Allison W. ;
  • Kyriacou, Kyriacos ;
  • Lambrechts, Diether ;
  • Lee, Derrick G. ;
  • Lindblom, Annika ;
  • Linet, Martha ;
  • Lissowska, Jolanta ;
  • Llaneza, Ana ;
  • Lo, Wing-Yee ;
  • MacInnis, Robert J. ;
  • Mannermaa, Arto ;
  • Manoochehri, Mehdi ;
  • Margolin, Sara ;
  • Martinez, Maria Elena ;
  • McLean, Catriona ;
  • Meindl, Alfons ;
  • Menon, Usha ;
  • Nevanlinna, Heli ;
  • Newman, William G. ;
  • Nodora, Jesse ;
  • Offit, Kenneth ;
  • Olsson, Håkan ;
  • Orr, Nick ;
  • Park-Simon, Tjoung-Won ;
  • Patel, Alpa V. ;
  • Peto, Julian ;
  • Pita, Guillermo ;
  • Plaseska-Karanfilska, Dijana ;
  • Prentice, Ross ;
  • Punie, Kevin ;
  • Pylkäs, Katri ;
  • Radice, Paolo ;
  • Rennert, Gad ;
  • Romero, Atocha ;
  • Rüdiger, Thomas ;
  • Saloustros, Emmanouil ;
  • Sampson, Sarah ;
  • Sandler, Dale P. ;
  • Sawyer, Elinor J. ;
  • Schmutzler, Rita K. ;
  • Schoemaker, Minouk J. ;
  • Schöttker, Ben ;
  • Sherman, Mark E. ;
  • Shu, Xiao-Ou ;
  • Smichkoska, Snezhana ;
  • Southey, Melissa C. ;
  • Spinelli, John J. ;
  • Swerdlow, Anthony J. ;
  • Tamimi, Rulla M. ;
  • Tapper, William J. ;
  • Taylor, Jack A. ;
  • Teras, Lauren R. ;
  • Terry, Mary Beth ;
  • Torres, Diana ;
  • Troester, Melissa A. ;
  • Vachon, Celine M. ;
  • van Deurzen, Carolien H. M. ;
  • van Veen, Elke M. ;
  • Wagner, Philippe ;
  • Weinberg, Clarice R. ;
  • Wendt, Camilla ;
  • Wesseling, Jelle ;
  • Winqvist, Robert ;
  • Wolk, Alicja ;
  • Yang, Xiaohong R. ;
  • Zheng, Wei ;
  • Couch, Fergus J. ;
  • Simard, Jacques ;
  • Kraft, Peter ;
  • Easton, Douglas F. ;
  • Pharoah, Paul D. P. ;
  • Schmidt, Marjanka K. ;
  • García-Closas, Montserrat ;
  • Chatterjee, Nilanjan
1 Citation0 Mentions85% FAIR0.9 Dataset Index
10.6084/m9.figshare.17870341.v12022

Additional file 2 of Breast cancer risks associated with missense variants in breast cancer susceptibility genes

Additional file 2.

Authors

  • Dorling, Leila ;
  • Carvalho, Sara ;
  • Allen, Jamie ;
  • Parsons, Michael T. ;
  • Fortuno, Cristina ;
  • González-Neira, Anna ;
  • Heijl, Stephan M. ;
  • Adank, Muriel A. ;
  • Ahearn, Thomas U. ;
  • Andrulis, Irene L. ;
  • Auvinen, Päivi ;
  • Becher, Heiko ;
  • Beckmann, Matthias W. ;
  • Behrens, Sabine ;
  • Bermisheva, Marina ;
  • Bogdanova, Natalia V. ;
  • Bojesen, Stig E. ;
  • Bolla, Manjeet K. ;
  • Bremer, Michael ;
  • Briceno, Ignacio ;
  • Camp, Nicola J. ;
  • Campbell, Archie ;
  • Castelao, Jose E. ;
  • Chang-Claude, Jenny ;
  • Chanock, Stephen J. ;
  • Chenevix-Trench, Georgia ;
  • Collée, J. Margriet ;
  • Czene, Kamila ;
  • Dennis, Joe ;
  • Dörk, Thilo ;
  • Eriksson, Mikael ;
  • Evans, D. Gareth ;
  • Fasching, Peter A. ;
  • Figueroa, Jonine ;
  • Flyger, Henrik ;
  • Gabrielson, Marike ;
  • Gago-Dominguez, Manuela ;
  • García-Closas, Montserrat ;
  • Giles, Graham G. ;
  • Glendon, Gord ;
  • Guénel, Pascal ;
  • Gündert, Melanie ;
  • Hadjisavvas, Andreas ;
  • Hahnen, Eric ;
  • Hall, Per ;
  • Hamann, Ute ;
  • Harkness, Elaine F. ;
  • Hartman, Mikael ;
  • Hogervorst, Frans B. L. ;
  • Hollestelle, Antoinette ;
  • Hoppe, Reiner ;
  • Howell, Anthony ;
  • Jakubowska, Anna ;
  • Jung, Audrey ;
  • Khusnutdinova, Elza ;
  • Kim, Sung-Won ;
  • Ko, Yon-Dschun ;
  • Kristensen, Vessela N. ;
  • Lakeman, Inge M. M. ;
  • Li, Jingmei ;
  • Lindblom, Annika ;
  • Loizidou, Maria A. ;
  • Lophatananon, Artitaya ;
  • Lubiński, Jan ;
  • Luccarini, Craig ;
  • Madsen, Michael J. ;
  • Mannermaa, Arto ;
  • Manoochehri, Mehdi ;
  • Margolin, Sara ;
  • Mavroudis, Dimitrios ;
  • Milne, Roger L. ;
  • Mohd Taib, Nur Aishah ;
  • Muir, Kenneth ;
  • Nevanlinna, Heli ;
  • Newman, William G. ;
  • Oosterwijk, Jan C. ;
  • Park, Sue K. ;
  • Peterlongo, Paolo ;
  • Radice, Paolo ;
  • Saloustros, Emmanouil ;
  • Sawyer, Elinor J. ;
  • Schmutzler, Rita K. ;
  • Shah, Mitul ;
  • Sim, Xueling ;
  • Southey, Melissa C. ;
  • Surowy, Harald ;
  • Suvanto, Maija ;
  • Tomlinson, Ian ;
  • Torres, Diana ;
  • Truong, Thérèse ;
  • van Asperen, Christi J. ;
  • Waltes, Regina ;
  • Wang, Qin ;
  • Yang, Xiaohong R. ;
  • Pharoah, Paul D. P. ;
  • Schmidt, Marjanka K. ;
  • Benitez, Javier ;
  • Vroling, Bas ;
  • Dunning, Alison M. ;
  • Teo, Soo Hwang ;
  • Kvist, Anders ;
  • de la Hoya, Miguel ;
  • Devilee, Peter ;
  • Spurdle, Amanda B. ;
  • Vreeswijk, Maaike P. G. ;
  • Easton, Douglas F.
1 Citation0 Mentions85% FAIR0.9 Dataset Index
10.6084/m9.figshare.197931802022

Additional file 1 of Association of germline genetic variants with breast cancer-specific survival in patient subgroups defined by clinic-pathological variables related to tumor biology and type of systemic treatment

Additional file 1: Supplementary Table S1, Supplementary Table S2, Supplementary Table S3, and Supplementary Table S4. Supplementary Table S1. Shows an overview of the Breast Cancer Association Consortium studies included in the analyses. Supplementary Table S2. Includes the rationale and references to the literature supporting the choice of each subgroup for inclusion in a genome-wide association study on breast cancer-specific survival. Supplementary Table S3. Shows the characteristics of the breast cancer patients included in the 15-year breast cancer-specific survival analyses, overall and by subgroup. Supplementary Table S4. Shows the characteristics of the breast cancer patients included in the 5-year breast cancer-specific survival analyses for subgroups defined based on type of systemic treatment received.

Authors

  • Morra, Anna ;
  • Escala-Garcia, Maria ;
  • Beesley, Jonathan ;
  • Keeman, Renske ;
  • Canisius, Sander ;
  • Ahearn, Thomas U. ;
  • Andrulis, Irene L. ;
  • Anton-Culver, Hoda ;
  • Arndt, Volker ;
  • Auer, Paul L. ;
  • Augustinsson, Annelie ;
  • Beane Freeman, Laura E. ;
  • Becher, Heiko ;
  • Beckmann, Matthias W. ;
  • Behrens, Sabine ;
  • Bojesen, Stig E. ;
  • Bolla, Manjeet K. ;
  • Brenner, Hermann ;
  • Brüning, Thomas ;
  • Buys, Saundra S. ;
  • Caan, Bette ;
  • Campa, Daniele ;
  • Canzian, Federico ;
  • Castelao, Jose E. ;
  • Chang-Claude, Jenny ;
  • Chanock, Stephen J. ;
  • Cheng, Ting-Yuan David ;
  • Clarke, Christine L. ;
  • Colonna, Sarah V. ;
  • Couch, Fergus J. ;
  • Cox, Angela ;
  • Cross, Simon S. ;
  • Czene, Kamila ;
  • Daly, Mary B. ;
  • Dennis, Joe ;
  • Dörk, Thilo ;
  • Dossus, Laure ;
  • Dunning, Alison M. ;
  • Dwek, Miriam ;
  • Eccles, Diana M. ;
  • Ekici, Arif B. ;
  • Eliassen, A. Heather ;
  • Eriksson, Mikael ;
  • Evans, D. Gareth ;
  • Fasching, Peter A. ;
  • Flyger, Henrik ;
  • Fritschi, Lin ;
  • Gago-Dominguez, Manuela ;
  • García-Sáenz, José A. ;
  • Giles, Graham G. ;
  • Grip, Mervi ;
  • Guénel, Pascal ;
  • Gündert, Melanie ;
  • Hahnen, Eric ;
  • Haiman, Christopher A. ;
  • Håkansson, Niclas ;
  • Hall, Per ;
  • Hamann, Ute ;
  • Hart, Steven N. ;
  • Hartikainen, Jaana M. ;
  • Hartmann, Arndt ;
  • He, Wei ;
  • Hooning, Maartje J. ;
  • Hoppe, Reiner ;
  • Hopper, John L. ;
  • Howell, Anthony ;
  • Hunter, David J. ;
  • Jager, Agnes ;
  • Jakubowska, Anna ;
  • Janni, Wolfgang ;
  • John, Esther M. ;
  • Jung, Audrey Y. ;
  • Kaaks, Rudolf ;
  • Keupers, Machteld ;
  • Kitahara, Cari M. ;
  • Koutros, Stella ;
  • Kraft, Peter ;
  • Kristensen, Vessela N. ;
  • Kurian, Allison W. ;
  • Lacey, James V. ;
  • Lambrechts, Diether ;
  • Le Marchand, Loic ;
  • Lindblom, Annika ;
  • Linet, Martha ;
  • Luben, Robert N. ;
  • Lubiński, Jan ;
  • Lush, Michael ;
  • Mannermaa, Arto ;
  • Manoochehri, Mehdi ;
  • Margolin, Sara ;
  • Martens, John W. M. ;
  • Martinez, Maria Elena ;
  • Mavroudis, Dimitrios ;
  • Michailidou, Kyriaki ;
  • Milne, Roger L. ;
  • Mulligan, Anna Marie ;
  • Muranen, Taru A. ;
  • Nevanlinna, Heli ;
  • Newman, William G. ;
  • Nielsen, Sune F. ;
  • Nordestgaard, Børge G. ;
  • Olshan, Andrew F. ;
  • Olsson, Håkan ;
  • Orr, Nick ;
  • Park-Simon, Tjoung-Won ;
  • Patel, Alpa V. ;
  • Peissel, Bernard ;
  • Peterlongo, Paolo ;
  • Plaseska-Karanfilska, Dijana ;
  • Prajzendanc, Karolina ;
  • Prentice, Ross ;
  • Presneau, Nadege ;
  • Rack, Brigitte ;
  • Rennert, Gad ;
  • Rennert, Hedy S. ;
  • Rhenius, Valerie ;
  • Romero, Atocha ;
  • Roylance, Rebecca ;
  • Ruebner, Matthias ;
  • Saloustros, Emmanouil ;
  • Sawyer, Elinor J. ;
  • Schmutzler, Rita K. ;
  • Schneeweiss, Andreas ;
  • Scott, Christopher ;
  • Shah, Mitul ;
  • Smichkoska, Snezhana ;
  • Southey, Melissa C. ;
  • Stone, Jennifer ;
  • Surowy, Harald ;
  • Swerdlow, Anthony J. ;
  • Tamimi, Rulla M. ;
  • Tapper, William J. ;
  • Teras, Lauren R. ;
  • Terry, Mary Beth ;
  • Tollenaar, Rob A. E. M. ;
  • Tomlinson, Ian ;
  • Troester, Melissa A. ;
  • Truong, Thérèse ;
  • Vachon, Celine M. ;
  • Wang, Qin ;
  • Hurson, Amber N. ;
  • Winqvist, Robert ;
  • Wolk, Alicja ;
  • Ziogas, Argyrios ;
  • Brauch, Hiltrud ;
  • García-Closas, Montserrat ;
  • Pharoah, Paul D. P. ;
  • Easton, Douglas F. ;
  • Chenevix-Trench, Georgia ;
  • Schmidt, Marjanka K.
1 Citation0 Mentions85% FAIR1.0 Dataset Index
10.6084/m9.figshare.15253977.v12021

Additional file 3 of Association of germline genetic variants with breast cancer-specific survival in patient subgroups defined by clinic-pathological variables related to tumor biology and type of systemic treatment

Additional file 3: Supplementary Table S8, Supplementary Table S9, Supplementary Table S10, Supplementary Table S11, and Supplementary Table S12. Supplementary Table S8. Shows the BFDPs under two more restrictive prior probabilities of true association (10-5 and 10-6) for the results presented in Table 1. Supplementary Table S9. Shows the BFDPs under two more restrictive prior probabilities of true association (10-5 and 10-6) for the results presented in Table 2. Supplementary Table S10. Shows power calculation by subgroup, at the two-sided 5E-08 level for varying genotype hazard ratio (GHR) and minor allele frequency (MAF), based on number of cases and event rate from the 15-year breast cancer-specific analyses. Supplementary Table S11. Shows power calculation by subgroup, at the two-sided 5E-08 level for varying genotype hazard ratio (GHR) and minor allele frequency (MAF), based on number of cases and event rate from the 5-year breast cancer-specific analyses. Supplementary Table S12. Shows the subgroup-specific associations detected by previous studies and corresponding estimates from the current study.

Authors

  • Morra, Anna ;
  • Escala-Garcia, Maria ;
  • Beesley, Jonathan ;
  • Keeman, Renske ;
  • Canisius, Sander ;
  • Ahearn, Thomas U. ;
  • Andrulis, Irene L. ;
  • Anton-Culver, Hoda ;
  • Arndt, Volker ;
  • Auer, Paul L. ;
  • Augustinsson, Annelie ;
  • Beane Freeman, Laura E. ;
  • Becher, Heiko ;
  • Beckmann, Matthias W. ;
  • Behrens, Sabine ;
  • Bojesen, Stig E. ;
  • Bolla, Manjeet K. ;
  • Brenner, Hermann ;
  • Brüning, Thomas ;
  • Buys, Saundra S. ;
  • Caan, Bette ;
  • Campa, Daniele ;
  • Canzian, Federico ;
  • Castelao, Jose E. ;
  • Chang-Claude, Jenny ;
  • Chanock, Stephen J. ;
  • Cheng, Ting-Yuan David ;
  • Clarke, Christine L. ;
  • Colonna, Sarah V. ;
  • Couch, Fergus J. ;
  • Cox, Angela ;
  • Cross, Simon S. ;
  • Czene, Kamila ;
  • Daly, Mary B. ;
  • Dennis, Joe ;
  • Dörk, Thilo ;
  • Dossus, Laure ;
  • Dunning, Alison M. ;
  • Dwek, Miriam ;
  • Eccles, Diana M. ;
  • Ekici, Arif B. ;
  • Eliassen, A. Heather ;
  • Eriksson, Mikael ;
  • Evans, D. Gareth ;
  • Fasching, Peter A. ;
  • Flyger, Henrik ;
  • Fritschi, Lin ;
  • Gago-Dominguez, Manuela ;
  • García-Sáenz, José A. ;
  • Giles, Graham G. ;
  • Grip, Mervi ;
  • Guénel, Pascal ;
  • Gündert, Melanie ;
  • Hahnen, Eric ;
  • Haiman, Christopher A. ;
  • Håkansson, Niclas ;
  • Hall, Per ;
  • Hamann, Ute ;
  • Hart, Steven N. ;
  • Hartikainen, Jaana M. ;
  • Hartmann, Arndt ;
  • He, Wei ;
  • Hooning, Maartje J. ;
  • Hoppe, Reiner ;
  • Hopper, John L. ;
  • Howell, Anthony ;
  • Hunter, David J. ;
  • Jager, Agnes ;
  • Jakubowska, Anna ;
  • Janni, Wolfgang ;
  • John, Esther M. ;
  • Jung, Audrey Y. ;
  • Kaaks, Rudolf ;
  • Keupers, Machteld ;
  • Kitahara, Cari M. ;
  • Koutros, Stella ;
  • Kraft, Peter ;
  • Kristensen, Vessela N. ;
  • Kurian, Allison W. ;
  • Lacey, James V. ;
  • Lambrechts, Diether ;
  • Le Marchand, Loic ;
  • Lindblom, Annika ;
  • Linet, Martha ;
  • Luben, Robert N. ;
  • Lubiński, Jan ;
  • Lush, Michael ;
  • Mannermaa, Arto ;
  • Manoochehri, Mehdi ;
  • Margolin, Sara ;
  • Martens, John W. M. ;
  • Martinez, Maria Elena ;
  • Mavroudis, Dimitrios ;
  • Michailidou, Kyriaki ;
  • Milne, Roger L. ;
  • Mulligan, Anna Marie ;
  • Muranen, Taru A. ;
  • Nevanlinna, Heli ;
  • Newman, William G. ;
  • Nielsen, Sune F. ;
  • Nordestgaard, Børge G. ;
  • Olshan, Andrew F. ;
  • Olsson, Håkan ;
  • Orr, Nick ;
  • Park-Simon, Tjoung-Won ;
  • Patel, Alpa V. ;
  • Peissel, Bernard ;
  • Peterlongo, Paolo ;
  • Plaseska-Karanfilska, Dijana ;
  • Prajzendanc, Karolina ;
  • Prentice, Ross ;
  • Presneau, Nadege ;
  • Rack, Brigitte ;
  • Rennert, Gad ;
  • Rennert, Hedy S. ;
  • Rhenius, Valerie ;
  • Romero, Atocha ;
  • Roylance, Rebecca ;
  • Ruebner, Matthias ;
  • Saloustros, Emmanouil ;
  • Sawyer, Elinor J. ;
  • Schmutzler, Rita K. ;
  • Schneeweiss, Andreas ;
  • Scott, Christopher ;
  • Shah, Mitul ;
  • Smichkoska, Snezhana ;
  • Southey, Melissa C. ;
  • Stone, Jennifer ;
  • Surowy, Harald ;
  • Swerdlow, Anthony J. ;
  • Tamimi, Rulla M. ;
  • Tapper, William J. ;
  • Teras, Lauren R. ;
  • Terry, Mary Beth ;
  • Tollenaar, Rob A. E. M. ;
  • Tomlinson, Ian ;
  • Troester, Melissa A. ;
  • Truong, Thérèse ;
  • Vachon, Celine M. ;
  • Wang, Qin ;
  • Hurson, Amber N. ;
  • Winqvist, Robert ;
  • Wolk, Alicja ;
  • Ziogas, Argyrios ;
  • Brauch, Hiltrud ;
  • García-Closas, Montserrat ;
  • Pharoah, Paul D. P. ;
  • Easton, Douglas F. ;
  • Chenevix-Trench, Georgia ;
  • Schmidt, Marjanka K.
1 Citation0 Mentions85% FAIR0.9 Dataset Index
10.6084/m9.figshare.152539952021